图3 《薛刚反唐连环画》人物图，中间为李旦
然而，最让太平公主感到忧心的是，认为李隆基太过聪明，又年富力强，不受摆布，有碍她的参政。于是处处阻挠和排挤李隆基，并派人监视他的行动，利用流言蜚语挑拨太子与皇帝之间的关系。甚至向外散布：李隆基不是李旦亲生的，立为皇嗣不合宗法，鼓动大臣们同意更换太子。由于以宋璟为首重臣的反对和抵制，太平公主的阴谋没有得逞。
起初，对于朝政大事，睿宗总是先找太平公主商量，而后再找太子李隆基，近来李旦越来越倾向于太子，因此太平公主心中不平，与李隆基的矛盾日益加剧。而后，太平公主又逼迫李旦更换太子，李旦见姑侄不和，十分不安，恐怕再出现政局混乱局面，于景云三年（712年），不顾太平公主的反对，把皇位让给了太子，改元“先天”，
李隆基成为唐玄宗，自己退为太上皇。此时太平公主与李隆基的矛盾更加尖锐，几乎到了剑拔弩张的程度。
由于太平公主多年的经营，在朝中建立了很大势力，朝臣中一半以上是她的人，多次指使亲信欲致李隆基于死地，甚至采用宫女下毒的方法，但都没有得逞。